Общее собрание совладельцев является наивысшим коллегиальным органом управления ЕГУ. В его работе участвуют организации, которые способствовали возрождению деятельности ЕГУ в Вильнюсе после его закрытия в Минске. В его состав входят: Центр исследований Восточной Европы (Литва), Фонд имени Конрада Аденауэра (Германия), Стокгольмкая школа экономики (Швеция), Фонды «Открытое общество» (США), представленные Фондом DDF (Лихтенштейн) и Фонд «Евразия» (США).
Непосредственно в работе Общего собрания совладельцев принимают участие:
Председатель Хортон Биби-Сентер
Представитель Фонда «Евразия»
Андерс Олофсгард
Представитель Стокгольмской школы экономики
Габриэле Бауманн
Глава белорусского бюро Фонда имени Конрада Аденауэра
